Одночасна молекулярно-генетична діагностика гермінальних (спадкових) та соматичних (набутих пухлинних) мутацій у генах системи гомологічної рекомбінації (HRR). Дослідження є критично важливим етапом для визначення чутливості пухлини до таргетної терапії PARP-інгібіторами та паралельної оцінки спадкових онкологічних ризиків для родини пацієнта. Панель BRCA Complete — це найсучасніший інструмент прецизійної онкології, розроблений спеціально для пацієнтів із вже встановленим онкологічним діагнозом. Мутації в генах BRCA1/2 та інших генах-супресорах можуть бути як гермінальними (успадкованими від батьків, наявними у всіх клітинах тіла), так і соматичними (виникають спонтанно виключно у тканині пухлини в процесі канцерогенезу). За статистикою, тестування лише крові (на гермінальні мутації) пропускає значну частку пацієнтів, чиї пухлини мають соматичні дефекти HRR. Дослідження гістологічного матеріалу (пухлини) разом із кров'ю підвищує частоту виявлення клінічно значущих мутацій до 65%, радикально розширюючи коло пацієнтів, які можуть отримати життєрятівну терапію інгібіторами PARP (наприклад, олапарибом), що є особливо актуальним при раку яєчників та передміхурової залози.
Клініко-генетичні кореляції та Терапевтичні мішені
Комплексний підхід дозволяє клінічному онкологу вирішити відразу два завдання: підібрати ефективну системну терапію (завдяки соматичному профілю) та визначити ризик других пухлин і небезпеку для родичів (завдяки гермінальному профілю).| Тип виявленої мутації | Локалізація генетичного дефекту | Клінічне та терапевтичне значення |
|---|---|---|
| Лише Соматична мутація (наприклад, у BRCA1/2) | Присутня виключно в тканині пухлини (FFPE-блок). Відсутня у крові/слині. | Терапія: Пухлина високочутлива до PARP-інгібіторів та препаратів платини. Спадковість: Мутація НЕ передається дітям. Ризик для кровних родичів не перевищує загальнопопуляційний. Немає підвищеного ризику інших спадкових пухлин у пацієнта. |
| Гермінальна (спадкова) мутація (BRCA1/2, PALB2, ATM тощо) | Присутня у всіх клітинах тіла (виявляється і в крові, і в пухлині). | Терапія: Абсолютне показання до таргетної терапії PARP-інгібіторами. Спадковість: 50% ризик передачі дітям. Обов'язковий каскадний скринінг родичів. Високий ризик розвитку других первинних пухлин (наприклад, раку молочної залози, яєчників, підшлункової) — показана ризик-знижуюча хірургія. |
| Відсутність мутацій (Дикий тип / Wild-type) | Не виявлено ні в крові, ні в пухлині. | Терапія: Стандартні протоколи лікування (низька ймовірність відповіді на інгібітори PARP). Спадковість: Спадковий синдром (HBOC) не підтверджено. |
Якість та достовірність результатів
Тестування пухлинного матеріалу (парафінових блоків — FFPE) є надзвичайно складним лабораторним завданням через процеси деградації, фрагментації та хімічної модифікації ДНК формаліном. Наш біоінформатичний пайплайн спеціально оптимізований для роботи з "пошкодженою" ДНК.Валідовані методи діагностики
- Подвійне NGS-секвенування (Illumina): Паралельне глибоке секвенування ДНК, виділеної з лейкоцитів крові (норма) та з парафінового блоку пухлини (сома). Це дозволяє безпомилково відрізнити гермінальний варіант від соматичного.
- Детекція низькоалельних варіантів: Алгоритми налаштовані на виявлення соматичних мутацій з низькою алельною частотою (від 5%), враховуючи гетерогенність пухлини та домішки нормальних клітин у зразку.
- CNV-аналіз: Виявлення структурних перебудов (великих делецій та дуплікацій), які часто зустрічаються як механізм інактивації другого алеля гена (втрата гетерозиготності — LOH) у пухлині.
Контроль якості та Акредитація
- Морфологічний контроль: Обов'язкова оцінка H&E зрізу пухлини лікарем-патологоанатомом перед екстракцією ДНК для підтвердження достатньої пухлинної клітинності (tumor cellularity).
- Акредитація: Виконання досліджень згідно з міжнародним стандартом медичних лабораторій ISO 15189:2012 та участю в європейських програмах зовнішнього контролю якості (EMQN).
Інтерпретація та медичний звіт
Оскільки панель тестує два різні біологічні матеріали, медичний висновок містить комплексну інтерпретацію за двома різними міжнародними номенклатурами.Класифікація варіантів
- Для крові (гермінальні мутації): Класифікація за критеріями ACMG/AMP (Патогенні, Ймовірно патогенні, VUS).
- Для пухлини (соматичні мутації): Класифікація за критеріями AMP/ASCO/CAP (Tier I - варіанти з сильним клінічним значенням, Tier II - варіанти з потенційним клінічним значенням).
Медичний висновок включає:
- Чітке розмежування статусу: статус спадкової мутації + статус соматичної мутації пухлини.
- Терапевтичні мішені: Прямі рекомендації (на основі NCCN та FDA) щодо можливості застосування інгібіторів PARP.
- Клінічну значущість (при виявленні гермінальної мутації): Оцінка ризиків для органів-мішеней, рекомендації щодо профілактичної хірургії та обов'язкового каскадного скринінгу родичів.
Біологічні зразки та логістика
Панель потребує одночасного надання нормального та пухлинного матеріалу пацієнта.Прийнятні зразки
- Пухлинний матеріал (FFPE-блоки): Парафіновий блок із тканиною пухлини (або 10-15 незабарвлених зрізів на предметних скельцях). Вимога: частка пухлинних клітин у зразку має становити не менше 20-30%. Разом із блоком обов'язково надається копія патогістологічного висновку.
- Нормальний матеріал: Кров (5-10 мл у вакутейнері з EDTA) АБО букальний епітелій (набір Oragene).
Логістика та Конфіденційність
- Забір та транспортування: Кур'єрський сервіс із патоморфологічних лабораторій та онкодиспансерів. Блоки транспортуються при кімнатній температурі, кров — при +2°C...+8°C.
- Повернення блоків: Після мікродисекції та екстракції ДНК парафінові блоки повертаються пацієнту або до медичного закладу в цілісному стані.
Професійна підтримка лікарів
Комплексне звітування вимагає ретельного клінічного розбору. При виявленні мутацій пацієнт отримує безкоштовну письмову онкогенетичну консультацію.Мультидисциплінарна взаємодія
- Клінічні онкологи: Найважливіший інструмент для лікування просунутих стадій. Виявлення соматичної або гермінальної мутації BRCA1/2 (а також часто ATM, PALB2) є прямим показанням до призначення олапарибу, нірапарибу або рукапарибу при платиночутливому рецидивуючому раку яєчників, HER2-негативному метастатичному раку молочної залози, метастатичному кастраційно-резистентному раку простати (мКРРП) та метастатичному раку підшлункової залози.
- Онкохірурги: Якщо виявлено гермінальну мутацію, у пацієнтки з РМЗ розглядається білатеральна мастектомія (замість збереження залози) через високий ризик другої пухлини. Якщо мутація лише соматична, ризик другої пухлини не підвищений, і хірургічна тактика залишається стандартною.
- Клінічні генетики: Ініціація генетичного тестування здорових родичів (дітей, братів, сестер) тільки у випадку підтвердження гермінальної мутації у крові пацієнта.
Клінічні показання для спеціалістів (згідно з МКХ-10)
Подвійне тестування (пухлина + кров) рекомендоване провідними онкологічними спільнотами (ESMO, ASCO, NCCN) для максимізації шансів знайти терапевтичну мішень. Дослідження абсолютно показане пацієнтам із вже діагностованими захворюваннями:Прямі клінічні показання
- C56 Злоякісне новоутворення яєчника (епітеліальний рак яєчників, маткових труб або первинний рак очеревини) — всім пацієнткам (особливо з серозною карциномою high-grade) для визначення тактики підтримуючої терапії після хіміотерапії на основі платини.
- C61 Злоякісне новоутворення передміхурової залози — пацієнтам із метастатичним кастраційно-резистентним раком простати (мКРРП) для призначення PARP-інгібіторів.
- C50 Злоякісне новоутворення молочної залози — пацієнтам із HER2-негативним метастатичним або місцевопоширеним РМЗ, а також пацієнтам з раннім тричі негативним РМЗ або РМЗ високого ризику.
- C25 Злоякісне новоутворення підшлункової залози — пацієнтам із метастатичною аденокарциномою, у яких хвороба не прогресує після першої лінії платиновмісної хіміотерапії (для переходу на підтримуючу таргетну терапію).
