Молекулярно-генетична діагностика гермінальних мутацій у генах системи репарації неспарених основ ДНК (MMR) для верифікації синдрому Лінча (спадкового неполіпозного колоректального раку) та асоційованих пухлин. Синдром Лінча є найпоширенішою причиною спадкового колоректального раку (КРР), становлячи до 5% від усіх випадків цього захворювання, а також провідною причиною спадкового раку ендометрія. Захворювання зумовлене мутаціями в генах MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 або делеціями гена EPCAM. Для пацієнта з КРР підтвердження синдрому Лінча кардинально змінює парадигму лікування: відмови від ад'ювантної хіміотерапії (фторпіримідинами) при II стадії пухлини, можливості застосування імунотерапії (інгібітори PD-1/PD-L1) та розширення обсягу хірургічного втручання. Для родичів пацієнта своєчасна діагностика та старт рутинного скринінгу з 20-25 років дозволяють ефективно профілактувати рак та виявляти його на виліковних стадіях.
Клініко-генетичні кореляції (Генотип-Фенотип)
Ризик розвитку конкретних пухлин та вік їх маніфестації суттєво залежать від того, який саме ген системи MMR зазнав мутації. Точне генотипування дозволяє лікарю персоналізувати протокол спостереження.| Мутований ген | Експресія білків при ІГХ пухлини | Клінічні особливості та онкологічні ризики |
|---|---|---|
| MLH1 | Втрата MLH1 та PMS2 | Найвищий пожиттєвий ризик КРР (до 80%) та раку ендометрія. Рання маніфестація (часто до 45 років). Високий ризик екстраколоніальних пухлин (рак шлунка, яєчників, уротелію, тонкої кишки). |
| MSH2 / EPCAM | Втрата MSH2 та MSH6 | Аналогічний до MLH1 високий ризик КРР. Мутації MSH2 мають найвищий ризик екстраколоніальних пухлин (особливо раку сечовивідних шляхів). Делеції 3' кінця EPCAM викликають епігенетичний сайленсинг MSH2. |
| MSH6 | Втрата MSH6 (MSH2 збережений) | Більш пізня маніфестація КРР порівняно з MLH1/MSH2, проте надзвичайно високий ризик раку ендометрія у жінок (до 71%). MSI у пухлині може бути слабко вираженою. |
| PMS2 | Втрата PMS2 (MLH1 збережений) | Найнижчий пожиттєвий ризик КРР (15-20%) та раку ендометрія (15%) серед усіх генів Лінча. Розвиток пухлин у значно старшому віці. |
Якість та достовірність результатів
Мутації при синдромі Лінча часто включають великі геномні перебудови (до 20% мутацій MSH2 та майже всі мутації EPCAM — це великі делеції). Звичайне секвенування їх не "побачить". Наш комплексний підхід гарантує виявлення всіх типів аномалій.Валідовані методи діагностики
- NGS-секвенування: Застосування платформи Illumina з гарантованим покриттям ≥100x для всіх екзонів цільових генів.
- Sanger-підтвердження: Незалежна верифікація виявлених патогенних варіантів класичним капілярним секвенуванням.
- CNV-аналіз: Високоточна біоінформатична детекція делецій та дуплікацій (структурних варіантів), що є критично необхідним для правильної діагностики синдрому Лінча.
Аналітичні характеристики
- Чутливість: >99,5% для виявлення SNV (однонуклеотидних замін) та інделів.
- Специфічність: >99,9%.
- Покриття: Повний аналіз кодуючих послідовностей та критичних сплайсингових ділянок (±20 bp).
Контроль якості
- Внутрішній контроль: Ретельна валідація кожного аналітичного запуску.
- Зовнішній контроль: Участь у міжнародних програмах оцінки якості генетичних досліджень (EMQN).
- Акредитація: Робота за міжнародним стандартом медичних лабораторій ISO 15189:2012.
Інтерпретація та медичний звіт
Формування медичного висновку OncoRisk Lynch базується на специфічних протоколах NCCN (Genetic/Familial High-Risk Assessment: Colorectal).Класифікація варіантів (ACMG/AMP)
- Патогенні (Class 5) та Ймовірно патогенні (Class 4): Варіанти, що підтверджують діагноз синдрому Лінча.
- VUS (Class 3): Варіанти невизначеного клінічного значення, що вимагають спостереження.
Міжнародні бази даних
- InSiGHT (International Society for Gastrointestinal Hereditary Tumours): Спеціалізована глобальна база даних для класифікації варіантів генів MMR, яку ми використовуємо разом із ClinVar та LOVD.
Медичний висновок включає:
- Точну номенклатуру знайденої мутації.
- Клінічну значущість: Оцінка ризиків розвитку КРР, раку ендометрія, яєчників, шлунка, сечовивідних шляхів, підшлункової залози та мозку.
- Рекомендації NCCN зі скринінгу: План ендоскопічного контролю (наприклад, колоноскопія кожні 1-2 роки починаючи з 20-25 років).
- Каскадний скринінг: Показання для обов'язкового генетичного тестування кровних родичів (ризик успадкування 50%).
Біологічні зразки та логістика
Для швидкого родинного скринінгу (навіть якщо родичі знаходяться в інших містах чи країнах) ми пропонуємо зручні неінвазивні методи.Прийнятні зразки
- Букальний епітелій (набори Oragene): Неінвазивний збір ДНК з внутрішньої поверхні щоки. Ідеально для масового каскадного скринінгу родини, зразок стабільний роками при кімнатній температурі.
- Кров: 5-10 мл EDTA (стандарт для пацієнтів у стаціонарі), транспортування при +2°C...+8°C.
Логістика
- Забір: Щоденний кур'єрський сервіс із клінік та онкодиспансерів.
- Біобанк: Зберігання виділеної ДНК при -80°C до 5 років.
Організаційні стандарти
Ми забезпечуємо повну юридичну, етичну та інформаційну безпеку при роботі зі спадковими даними.Акредитація та ліцензування
- ISO 15189:2012 — міжнародний клініко-лабораторний стандарт.
- Ліцензія МОЗ України на медичну діагностику (АЕ №638712).
Терміни та конфіденційність
- Термін виконання: 14 робочих днів.
- Захист інформації: Псевдонімізація зразків та GDPR-відповідність.
Професійна підтримка лікарів
Лабораторія надає безкоштовну письмову онкогенетичну консультацію для лікаря та пацієнта при виявленні патогенної мутації.Мультидисциплінарна взаємодія
- Клінічні онкологи: Пацієнтам із КРР II стадії та підтвердженим дефіцитом MMR (синдромом Лінча) не рекомендована ад'ювантна хіміотерапія на основі 5-фторурацилу через її неефективність у цій групі. Водночас такі пухлини (через високу мутаційну гілку) демонструють вражаючу відповідь на імунотерапію (інгібітори чекпойнтів PD-1/PD-L1).
- Абдомінальні хірурги: Через надзвичайно високий ризик метахронного (повторного) раку, при виявленні КРР у пацієнта з синдромом Лінча стандартом є виконання субтотальної колектомії замість сегментарної резекції.
- Онкогінекологи: Для жінок-носіїв мутацій (особливо MLH1, MSH2, MSH6) розглядається профілактична гістеректомія з двобічною сальпінгооофоректомією після завершення репродуктивної функції.
- Ендоскопісти: Оскільки аденоми при синдромі Лінча прогресують до раку всього за 1-3 роки (замість 10 років у популяції), колоноскопія з видаленням поліпів має проводитися щорічно або раз на 2 роки.
Клінічні показання для спеціалістів (згідно з МКХ-10)
Дослідження гермінальних мутацій абсолютно показане пацієнтам, які відповідають Амстердамським критеріям II або критеріям Бетесди, а також тим, чия пухлина демонструє мікросателітну нестабільність (MSI). Показання включають:Особистий анамнез пацієнта
- C18-C20 Колоректальний рак, діагностований у віці до 50 років.
- C54 Злоякісне новоутворення тіла матки (рак ендометрія), діагностований у віці до 50 років.
- Наявність синхронних або метахронних (множинних) КРР чи інших пухлин, асоційованих із синдромом Лінча (рак шлунка, яєчників, підшлункової залози, уротелію, мозку, тонкої кишки).
- КРР з гістологічними ознаками високої мікросателітної нестабільності (персневидноклітинний або медулярний тип, виражена лімфоцитарна інфільтрація) у віці до 60 років.
- Результати ІГХ/ПЛР пухлини: КРР або рак ендометрія будь-якого віку з виявленим дефіцитом білків репарації (dMMR) за даними імуногістохімії або високою мікросателітною нестабільністю (MSI-H), за умови виключення соматичної мутації BRAF V600E та гіперметилювання промотора MLH1.
Сімейний анамнез (Амстердамські критерії II)
- Три або більше родичі з КРР або раком, асоційованим із синдромом Лінча (один із них має бути родичем 1-го ступеня для двох інших).
- Онкологічні захворювання відзначаються принаймні у двох послідовних поколіннях.
- Хоча б в одному випадку рак розвинувся у віці до 50 років.
- Відома гермінальна мутація в генах панелі (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM) у родині — пряме показання для каскадного скринінгу здорових членів сім'ї.
